O percurso científico da Professora Maria Manuel Baptista caracteriza-se por uma clara interdisciplinaridade. A sua formação inicial em Filosofia forneceu-lhe uma base teórica e epistemológica sólida. No mestrado, aprofundou o modo específico de construção do conhecimento nas ciências sociais, com especial aplicação à educação, adquirindo uma formação metodológica significativa nas áreas da psicologia, sociologia e antropologia. A dissertação de mestrado que desenvolveu incidiu precisamente sobre a área da Psicologia Social. No doutoramento, dedicou-se ao estudo de metodologias específicas das humanidades. Em 2013, durante as provas de agregação, abordou os campos das ciências da comunicação e dos estudos artísticos. Com este vasto panorama teórico-metodológico, integrou-se no campo dos Estudos de Cultura, área na qual leciona e desenvolve investigação, abrangendo temas diversos, desde a cultura portuguesa ao turismo cultural. Desde 2008, tem-se dedicado de forma crescente aos Estudos Culturais (Cultural Studies), conforme praticados internacionalmente. Numa altura em que este campo era praticamente inexistente em Portugal, introduziu-o no país em 2010 através da criação, em parceria com a Universidade do Minho, do primeiro programa doutoral em Estudos Culturais. Desde então, toda a sua atividade profissional tem sido orientada para a construção nacional e a projeção internacional dos Estudos Culturais em Portugal, tendo transformado a Universidade de Aveiro na instituição de referência nesta área. Estabeleceu numerosos protocolos internacionais com instituições no Brasil, Angola e Moçambique, acolhendo ao longo dos anos dezenas de estudantes e pós-doutorandos oriundos desses países, muitos dos quais são hoje doutores que consolidam o campo dos Estudos Culturais nos seus contextos de origem. Na Europa, desenvolveu ligações estreitas com investigadores britânicos de Birmingham, associados à Fundação e Arquivo Stuart Hall, participando no projeto Global Cultural Studies. Mantém também colaborações ativas com instituições na Polónia, Itália, Espanha e Noruega. Nos últimos anos, no âmbito dos Estudos Culturais, tem-se centrado em questões de Género, Performance e Estudos do Lazer, tendo sido recentemente eleita Presidente de uma das mais antigas associações ibero-americanas de investigação na área. Atualmente, dirige o Centro de Investigação em Línguas, Literaturas e Culturas da Universidade de Aveiro.